Обоснование: депрессивные симптомы часто составляют одно из клинических проявлений шизофрении, изменяя выраженность и восприятие основных клинических признаков заболевания. Степень выраженности психопатологических симптомов оказывает влияние на течение и развитие шизофрении. Генетические исследования выявили частичное перекрытие генетического риска между шизофренией и депрессивными расстройствами. Цель исследования: изучить генетические ассоциации выраженности позитивных и негативных симптомов шизофрении у пациентов с депрессивными проявлениями и без них. Пациенты и методы: проведено сравнительное кросс-секционное исследование пациентов с диагнозом шизофрении. В исследование были включены 390 пациентов, из которых 124 (31,8%) имели признаки депрессивного расстройства. Участники исследования относились к одной из трех этнических групп: русские, башкиры, татары. Оценка депрессивных проявлений проводилась с помощью Шкалы депрессии Калгари для больных шизофренией (The Calgary Depression Scale for Schizophrenia, CDSS). Для оценки выраженности психопатологических симптомов использовалась Шкала оценки позитивных и негативных синдромов (Positive and Negative Syndrome Scale, PANSS). Для определения генетических ассоциаций были выбраны следующие гены и полиморфизмы: MTNR1A rs34532313, MTNR1B rs10830963, CLOCK rs 1801260, HTR2A rs6313, PER2 rs934945, eNOS rs1549758, eNOS rs1799983. Анализ данных проводился с помощью непараметрических статистических методов: критерия Манна–Уитни, t-теста Стьюдента, χ2 -критерия Пирсона. Результаты: у пациентов с депрессивными проявлениями носительство минорного аллеля полиморфизма MTNR1A rs34532313 ассоциировалось с меньшей выраженностью симптомов P4, N7; полиморфизма HTR2A rs6313 — с меньшей выраженностью P4; полиморфизма PER2 rs934945 — с меньшей выраженностью P7 по Шкале PANSS. В группе пациентов без значимых депрессивных проявлений была обнаружена ассоциация между носительством минорного аллеля MTNR1A rs34532313 и большей выраженностью симптомов Р6. Выводы: депрессивные проявления у пациентов с шизофренией могут модифицировать ассоциации между полиморфными вариантами генов и выраженностью отдельных психопатологических симптомов.