Статья
ПОИСК ИЗМЕНЕНИЙ НУКЛЕОТИДНОЙ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ ГЕНА РЕМОДЕЛИРОВАНИЯ ХРОМАТИНА PBRM1 У ПАЦИЕНТОВ СО СВЕТЛОКЛЕТОЧНЫМ РАКОМ ПОЧКИ
Рак почки (РП) - это гетерогенная группа злокачественных опухолей, подавляющее большинство которых представляет собой почечно-клеточные карциномы различных морфологических типов, наиболее часто встречается светлоклеточный рак почки (СРП). Особое внимание в канцерогенезе СРП уделяется ряду генов-супрессоров опухолевого роста, расположенных на коротком плече третьей хромосомы. Одним из таких генов, инактивируемых при СРП, является ген полибромо 1 (PBRM1), кодирующий субъединицу PBAF SWI/SNF комплекса ремоделирования хроматина BAF180. Ген PBRM1 расположен на коротком плече третьей хромосомы в области 3р21 вблизи гена фон Хиппеля-Линдау (VHL), мутации в котором чаще всего происходят при СРП. Целью настоящего исследования был поиск изменений нуклеотидной последовательности гена-супрессора опухолевого роста PBRM1 у пациентов со светлоклеточным раком почки. В работе исследовано 210 парных образцов ДНК, выделенных из опухолевой ткани почки и прилегающей нормальной почечной паренхимы пациентов с СРП. Анализ изменений нуклеотидной последовательности ДНК проводили методом высокочувствительного анализа кривых плавления (HRM) с последующим секвенированием. В гене PBRM1 было обнаружено две соматические мутации (c.233G>A (p.D45N) во 2-м экзоне и c.1675-1676delTC в 15-м экзоне), не описанные ранее, и один известный полиморфный вариант rs17264436 (в 23-м экзоне). Частота выявленных мутаций составила 0.95 % случаев. Оценка функциональной значимости таких изменений показала, что мутации c.233G>A (p.D45N) и c.1675-1676delTC в гене PBRM1 имеют потенциально патогенный характер. Анализ ассоциации аллелей полиморфного локуса rs17264436 выявил статистически значимое повышение риска развития заболевания с тяжелым течением у носителей аллеля rs17264436*A, что может быть использовано при разработке панелей прогностических маркеров. Возможно, низкая частота мутаций у исследованных образцов связана с тем, что инактивация гена PBRM1 происходит иными способами, а также может быть обусловлена этноспецифичностью изученной группы пациентов.