История развития онкологической службы берёт своё начало с августа 1945 года. На базе хирургического отделения республиканской клинической больницы (РКБ), открыт онкологический диспансер (РОД) на 50 коек. Развитие онкологической службы происходило за счет расширения мест в республиканском онкологическом диспансере на базе РКБ, открытию новых отделений в городах Башкирии и объединению профессионалов, занимающихся применением ионизирующих и прочих видов излучения в медицине для целей лечения и диагностики заболеваний. В 1966 году происходит перевод диспансера в новый корпус, а в 1969 году происходит объединение Республиканского онкологического диспансера с Уфимским городским. В 1980-е годы Республиканский онкологический диспансер является самым крупным онкологическим диспансером страны, в нём были организованы 10 профильных клинических отделений, из которых 8 хирургического и 2 радиологического профиля. Начиная с 1990-х годов на базе диспансера функционируют кафедры лучевой диагностики и онкологии Башкирского Государственного Медицинского Университета (БГМУ). В июне 2010 года происходит открытие хирургического корпуса, оснащенного современным технологичным оборудованием. В 2014 году на базе диспансера открыт ПЭТцентр. На сегодняшний день онкологическая служба представлена многоуровневой структурой включая онкодиспансер, межрайонные онкологические отделения, межмуниципальные медицинские онкоцентры, центры амбулаторной онкологической помощи и первичные онкологические кабинеты.