Идентификацию выделенных культур микроорганизмов с кожи и в кале проводили с использованием MALDI-ToF MS. Результаты: преобладающей группой облигатных микроорганизмов кожи у детей с АтД были стафилококки, выделенные у 63,3% пациентов, на втором месте – различные представители рода Acinetobacter (30%), на третьем – Streptococcus salivarius (8,3%). Условно-патогенные микроорганизмы присутствовали на кожном покрове у 58,8% детей, чаще всего – Staphylococcus aureus (15%), Staphylococcus haemolyticus и Enterococcus faecalis (по 11,7%). В результате исследования видового состава кишечного микробиома установлено, что чаще всего выявлялись Bifidobacterium longum (56,7%) и Lactobacillus paracasei (30%). При анализе зависимости тяжести АтД от количества бифидо- и лактобактерий выявлена обратная корреляционная связь (Ккорр=0,52). Среди условно-патогенных бактерий в фекалиях на первом месте находилась K. oxytoca (26,7%), на втором – E. сloacae (16,7%), на третьем – C. freundii (15%). В итоге оценки взаимосвязи степени дисбиоза на степень тяжести АтД по индексу SCORAD установлена высокая степень прямой корреляции (Ккорр=0,74). Заключение: микробиологическое исследование кожи позволило определить видовой состав облигатной микрофлоры биотопов кожи и кишечника и предположить их влияние на течение АтД.