Дата публикации: 2024

DOI: 10.17537/2024.19.322

Ген trolC является гомологом онкогена rolC Agrobacterium rhizogenes и попал в геном Nicotiana tabacum, вероятнее всего, в результате горизонтального переноса генов. Этот ген довольно консервативен, экспрессируется в молодых органах, однако его функции, как и агробактериального гена rolC, остаются неизвестными. В настоящей работе проанализирована предположительная структура белка tRolC Nicotiana tabacum, предсказанная с помощью сервиса I-TASSER. Наличие у белка tRolC аминокислотных остатков активного центра и сайта связывания, а также белок-связывающей и ARTT-петли, сходных по структуре с белком 6b Agrobacterium vitis, свидетельствует о выполнении ими сходных биологических функций. На основе полученных данных высказана гипотеза о наличии у белка tRolC АДФ-рибозилтрансферазной активности, позволяющей ему влиять на рост и устойчивость растений к стрессам, а также на биосинтез вторичных метаболитов посредством влияния на регуляцию экспрессии генов через взаимодействие с факторами транскрипции, компонентами РНК-интерференции или проявление гистоноподобной активности.

Издатель: Russian Academy of Sciences,Department of the Earth Sciences

Тип: Article

Publication date: 2024

DOI: 10.17537/2024.19.322

The trolC gene is a homologue of the rolC oncogene of Agrobacterium rhizogenes and most likely got into Nicotiana tabacum genome during horizontal gene transfer. This gene is quite conserved and is expressed in young organs, but its functions, like the agrobacterium rolC gene, remain unknown. The putative structure of the tRolC protein of Nicotiana tabacum, predicted using the I-TASSER service, was analyzed in the study. The presence of amino acid residues in the tRolC protein of the active center and binding site, as well as a protein-binding and ARTT loop, similar in structure to protein 6b of Agrobacterium vitis, indicates that they perform similar biological functions. Based on the data, a hypothesis was put forward about the presence of ADP-ribosyltransferase activity in the tRolC protein, which allows it to influence the growth and stress tolerance, as well as the biosynthesis of secondary metabolites by influencing the regulation of gene expression through interaction with transcription factors, RNA interference, or the manifestation of histone-like activity. © (2024), (Russian Academy of Sciences). All rights reserved.

Издатель: Russian Academy of Sciences,Department of the Earth Sciences

Тип: Article