Взаимосвязь между полиморфизмами генов хемокинов и хемокиновых рецепторов и восприимчивостью к хронической обструктивной болезни легких у татарского населения из России: исследование случай-контроль

Дата публикации: 2022

DOI: 10.1007/s10528-021-10087-2

Аннотация:

Хроническая обструктивная болезнь легких (ХОБЛ) - это хроническое воспалительное заболевание легких, поражающее в первую очередь дистальные дыхательные пути и паренхиму легких. Это исследование было направлено на определение возможной генетической ассоциации полиморфизмов генов хемокинов и хемокиновых рецепторов с ХОБЛ в татарской популяции из России. SNP CCL20 , CCR6 , CXCL8 , CXCR1, CXCR2 , CCL8 , CCL23 , CCR2 и CX3CL1гены и их гено-генные взаимодействия были проанализированы на предмет связи с ХОБЛ в когорте из 601 пациента и 617 контрольных. В результате статистически значимые ассоциации с ХОБЛ в исследуемой группе при биологически правдоподобном предположении аддитивной генетической модели были выявлены в CCL20 (rs6749704) ( P = 0,00001, OR 1,55) , CCR6 (rs3093024) ( P = 0,0003, OR 0,74), CCL8 (rs3138035) ( P = 0,0001, OR 0,67), CX3CL1 (rs170364) ( P = 0,023, OR 1,21), CXCL8 (rs4073) ( P = 0,007, OR 1,23), CXCR2 (rs2230054) ( P= 0,0002, OR 1,32). После SNP CCL20 (rs6749704), CX3CL1 (rs170364), CCL8 (rs3138035), CXCL8 (rs4073), CXCR2 (rs2230054) показали статистически значимую связь с ХОБЛ только у курильщиков. Связь CCR6 (rs3093024) с ХОБЛ была подтверждена как у курильщиков, так и у некурящих. Связь между индексом курения и CCL20 (rs6749704) ( P = 0,04), CCR6 (rs3093024) ( P = 0,007), CCL8 ( rs3138035) ( P = 0,0043) и CX3CL1 (rs170364) ( P= 0,04). Для CCL23 (rs854655) наблюдалась значительная генотип-зависимая вариация форсированной жизненной емкости легких ( P = 0,04). На соотношение объема форсированного выдоха за 1 с / форсированной жизненной емкости легких влияли CCL23 (rs854655) ( P = 0,05) и CXCR2 (rs1126579) ( P = 0,02). Используя алгоритм APSampler, мы получили девять комбинаций ген-ген, которые оставались достоверно связанными с ХОБЛ; локусы CCR2 (rs1799864) и CCL8 (rs3138035) были вовлечены в наибольшем числе комбинаций. Наши результаты показывают, что CCL20 (rs6749704), CCR6 (rs3093024), CCR2Полиморфизмы (rs1799864), CCL8 (rs3138035), CXCL8 (rs4073), CXCR1 (rs2234671), CXCR2 (rs2230054) и CX3CL1 (rs170364) прочно связаны с ХОБЛ у татарской популяции из России, как по отдельности, так и в комбинации. Впервые были рассмотрены комбинации соответствующих SNP, и в результате 8 паттернов SNP были связаны с повышенным риском ХОБЛ.

Издатель: Springer

Тип: Article



The Relationship Between Chemokine and Chemokine Receptor Genes Polymorphisms and Chronic Obstructive Pulmonary Disease Susceptibility in Tatar Population from Russia: A Case Control Study

Publication date: 2022

DOI: 10.1007/s10528-021-10087-2

Abstract:

Chronic obstructive pulmonary disease (COPD) is a chronic inflammatory lung disease affecting primarily distal respiratory pathways and lung parenchyma. This study aimed to determine possible genetic association of chemokine and chemokine receptor genes polymorphisms with COPD in a Tatar population from Russia. SNPs of CCL20, CCR6, CXCL8, CXCR1, CXCR2, CCL8, CCL23, CCR2, and CX3CL1 genes and their gene–gene interactions were analyzed for association with COPD in cohort of 601 patients and 617 controls. As a result statistically significant associations with COPD in the study group under the biologically plausible assumption of additive genetic model were identified in CCL20 (rs6749704) (P = 0.00001, OR 1.55), CCR6 (rs3093024) (P = 0.0003, OR 0.74), CCL8 (rs3138035) (P = 0.0001, OR 0.67), CX3CL1 (rs170364) (P = 0.023, OR 1.21), CXCL8 (rs4073) (P = 0.007, OR 1.23), CXCR2 (rs2230054) (P = 0.0002, OR 1.32). Following SNPs CCL20 (rs6749704), CX3CL1 (rs170364), CCL8 (rs3138035), CXCL8 (rs4073), CXCR2 (rs2230054) showed statistically significant association with COPD only in smokers. The association of CCR6 (rs3093024) with COPD was confirmed both in smokers and in non-smokers. A relationship between smoking index and CCL20 (rs6749704) (P = 0.04), CCR6 (rs3093024) (P = 0.007), CCL8 (rs3138035) (P = 0.0043), and CX3CL1 (rs170364) (P = 0.04) was revealed. A significant genotype-dependent variation of Forced Vital Capacity was observed for CCL23 (rs854655) (P = 0.04). Forced Expiratory Volume in 1 s / Forced Vital Capacity ratio was affected by CCL23 (rs854655) (P = 0.05) and CXCR2 (rs1126579) (P = 0.02). Using the APSampler algorithm, we obtained nine gene–gene combinations that remained significantly associated with COPD; loci CCR2 (rs1799864) and CCL8 (rs3138035) were involved in the largest number of the combinations. Our results indicate that CCL20 (rs6749704), CCR6 (rs3093024), CCR2 (rs1799864), CCL8 (rs3138035), CXCL8 (rs4073), CXCR1 (rs2234671), CXCR2 (rs2230054), and CX3CL1 (rs170364) polymorphisms are strongly associated with COPD in Tatar population from Russia, alone and in combinations. For the first time combination of the corresponding SNPs were considered and as a result 8 SNP patterns were associated with increased risk of COPD © 2021, The Author(s), under exclusive licence to Springer Science+Business Media, LLC, part of Springer Nature.

Издатель: Springer

Тип: Article